后勤处与后勤服务集团合署，实行“两块牌子、一套人马”的运行机制，目前下设有10个职能部门，分别是综合科、后勤事务管理科（含节能办）、卫生所（代管）、综合服务中心、饮食服务中心、宿舍服务中心、资产管理服务中心、维修服务中心、物业服务中心（含爱卫办）、江南校区服务中心，现有员工近463人。分为行政服务型部门（含学校按人员核拨经费实行行政模式运作中心）、学校按人员和项目核拨经费实行半企业化模式运作部门、全企业化模式运作部门。